秦王、晋王相继死去。拥有重兵对朝廷足以构成威胁的就数燕王了。朱元璋在付燕王以北边重任的同时，也对他有所防犯。朱元璋临终之时，皇太孙朱允炆和附马都尉梅殷在他身边。朱元璋嘱咐朱允炆说："燕王不可忽。"接着又对梅殷说："汝老成忠信，可托幼主。"随后他拿出誓诏和遗诏交给梅殷，并说："敢有违天者，汝其为朕伐之。" 当时受顾命的还有齐泰和黄子澄。

朱元璋终于离开了人间。

他留下了最后一道诏书，遗诏说：

皇帝诏曰：朕受皇天之命，膺大命于世，定祸乱而偃兵，安民生于市野，谨抚驭以膺天命，今三十一年矣。忧危积心。日勤不怠，专志有益于民。奈何起自寒微，无古人博志，好善恶恶，不及多矣。今年七十有一，筋力衰微，朝夕忧惧，惟恐不终，今得万物自然之理，其奚念之有？皇太孙仁明孝友。天下归心，宜登大位，以勤民政，中外文武臣僚同心辅佐，以福吾民，凡丧葬之仪，一如汉文勿异。布告天下，使明知朕意。孝陵山川因其故，毋有所改。

一、天下臣民令到，出临三日，皆释服，嫁娶饮酒皆无禁。

二、无发民哭临宫殿中，当临者皆以旦晡，各一十五声，举哀，礼毕。非旦晡临，毋得擅哭。

一、当给丧及哭临者，皆毋跣，绖带毋过三寸，无布车兵器。

一、诸王各于本国哭临，不必赴京，中外官军戍守官员，毋得擅离信地，许遣人至京。

一、王国所在文武衙门军士，今后一听朝廷节制。护卫官军王自处分。

一、诸不在令中者，皆以此令比类从事。

故兹诏示，想宜知悉。