事情到此本应完结，但民间传说发挥了想象力，说此时真的建文帝"适有南归之思"，就向地方官讲出实情。御使密奏朝廷，将一­干­人送往京师。朝廷派曾服侍过建文帝的老宦官吴亮辨别建文帝真伪。建文帝见到吴亮就说："汝非吴亮耶？"吴亮说："非也。"建文帝说："吾昔御便殿汝尚食，食子鹅，弃片­肉­于地，汝手执壶，据地狗餂之。乃云非耶？"吴亮伏地而哭。建文帝左脚趾有黑子，吴亮摩视之，抱着建文帝的脚，哭得不能仰视。由于羞愧，吴亮退而自经死。于是建文帝被迎入西内。跟随建文帝云游的程济听到这个消息说："今日方终臣职矣。"就前往云南焚烧了庵庙，遣散了徒众。建文帝入宫后，宫人都称他为老佛。后来，建文帝以寿终，葬于西山，不封不树。

读了类似的记载，我们感到人们是在­精­心编织着故事，惟恐发生漏洞，不能自圆其说。即使如此，我们还是看到这些记载有很多矛盾、歧异。

比如，《建文皇帝遗迹》（即《备遗录》）说建文帝归来在宣德元年（1426年）丙午孟春。"少帝自江南来归京师"，且自称"吾今年七十余"。（按，如建文帝不死，当年应为四十九岁）建文帝与老宦官见面时，说的是另一番话："吾于七夕之时，赐桃实三枚与尔。尔匍匐阶下，食其一，以怀其二。吾问尔藏之由，尔对曰："臣有父老在家，欲怀此以献。"吾嘉尔孝，复赐五枚。今颇忆此否？"老宦官忽觉悟，遂抱持大哭。于是一时故臣都来看望。在建文帝身份得到证实后，宣宗命将其"厚养于诸王馆中"。但不久，"一夕暴卒"。后"以公礼葬于郊外"。

祝允明《野记》，也有大致相同的记载。郎瑛《七修类稿》则说：建文帝"竟葬西山，树碑曰"天下大法师之墓""。

所谓葬于北京西山，是指今北京阜城门外的海淀区内，据说就在今西三环路内的中国画研究院里。院里的白塔庵塔，就是建文帝安葬后建的衣钵塔。

关于建文帝的下落的说法特别多，几不胜数。

▲建文帝先隐藏于江苏吴县普济寺，后经姚广孝帮助，隐藏于穹窿山皇驾庵，死后就葬在穹窿山上。

▲建文帝曾藏在四川平昌佛罗寺，死后就葬在寺后山坡上。因建文帝经常在寺中面向京城哭泣，后人就将平罗寺改称为望京寺。

▲建文帝从云南大理逃到四川宜宾越溪河，隐居于隆兴，死后葬在隆兴的地下塔林（俗称空山，凿空山地而建墓）。甚至传说清康熙帝也曾来到越溪查访建文帝的遗迹。

▲云南武定狮子山，相传建文帝曾在此山正续禅寺驻锡。寺中现有惠帝祠阁，阁内彩塑三尊僧像，中间一尊身披袈裟，背靠龙椅，据说就是建文帝像。像为清康熙初年所造。龛额书"明惠帝"三字。阁前对联写道："僧为帝，帝亦为僧，数十载衣钵相传，正觉依旧皇觉旧；叔负侄，侄不负叔，八千里芒鞋徒步，狮山更比燕山高。"据说寺内的乾坤双树、龙凤翠柏、月潭潜龙等十余处景物都与建文帝有关。

▲重庆市的龙兴古镇，相传建文帝曾在此地的龙藏寺为僧，"龙兴"亦因此而得名。